细菌基因组肺炎克雷伯菌的耐药分析

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（一）肺炎克雷伯菌

肺炎克雷伯菌属于克雷伯菌属的肠杆科菌，为一类较短促的革兰氏阴性细菌。无芽孢，无鞭毛，有荚膜。克雷伯菌属包含7种及亚种，分别为产酸克雷伯菌，解鸟氨酸克雷伯菌，植生克雷伯菌，土生克雷伯菌，肺炎克雷伯菌肺炎亚种，肺炎克雷伯菌鼻硬结亚种。肺炎克雷伯菌是对人有较强致病性，是重要的条件致病菌和医源性、社区获得性细菌。

（二）多粘菌素耐药基因mcr-9在欧洲碳青霉烯类耐药的肺炎克雷伯菌中发现碳青霉烯和多粘菌素耐药的革兰氏阴性杆菌的出现和传播限制了我们治疗多重耐药感染（尤其是革兰氏阴性的肠杆科细菌）的选择。我们发现：①可移动的多粘菌素耐药基因mcr-9基因已经广泛的存在于碳青霉烯耐药的肺炎克雷伯菌（CRKP）中，这些CRKP分布在欧洲的多个国家样本，其中包括：比利时，丹麦，黑山共和国，波兰，罗马尼亚，塞尔维亚，斯洛文尼亚和西班牙国家。②值得注意是，mcr-9基因可以与多种碳青霉烯酶（NDM-1,VIM-1,OXA-48）在同一株CRKP菌株中检测到。③系统进化树分析表明，携带mcr-9基因的CRKP菌株呈现明显的地理聚类。④遗传背景分析发现，mcr-9基因附近存在插入元件IS,IS1等序列，有可能帮助可移动的多粘菌素耐药基因mcr-9在不同细菌之间转移。⑤由于这些CRKP菌株是至医院中的病人分离来的，提示mcr-9基因已经在欧洲存在了很长时间，并已经传播到CRKP中，对公共卫生有很大的威胁。

主要展示图：

图A：系统进化树分析mcr-9阳性菌株；B：mcr-9基因的遗传环境比较分析

综述所述，我们发现多粘菌素耐药基因mcr-9基因已经在欧洲人源的碳青霉烯类耐药的肺炎克雷伯菌中存在很长时间，至少分布在8个欧洲国家。这些结果增加了未检测到的可移动的多粘菌素耐药基因mcr-9基因在肠杆科碳青霉烯耐药（CRE）菌株中的持续传播的可能性。因此，迫切需要进一步的研究mcr基因的流行和传播，特别是CRE菌株，并采取有效的措施来控制其传播。

（三）医院获得性碳青霉烯类耐药的肺炎克雷伯菌在欧洲的流行

主要内容：

从欧洲32个国家家医院的个样本中分离到株肺炎克雷伯菌（KP），分析基因组序列和流行病数据。研究发现，碳青霉烯酶的获得是导致细菌耐碳青霉烯类抗生素的主要原因。然而，在株（69.9%）碳青霉烯耐药的肺炎克雷伯菌（CRKP）中，有株集中于4个克隆株中，分别为ST11型，ST15型，ST型，ST/型等。结合分析遗传距离和地理不同等因素，发现肺炎克雷伯菌的传播在一个国家的院内传播远比不同国家之间传播要频繁的多。

主要结果：

①细菌的菌群结构及碳青霉烯酶类耐药基因

②碳青霉烯类耐药菌株的遗传多样性

③地理分布

④不同的传播方式

⑤ST/型的传播和流行

主要图表：

图1碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌的地理分布

图2肺炎克雷伯菌的系统进化树

图3碳青霉烯耐药株有很强的地理聚类

图4CRKP菌株ST/型的传播与流行

肺炎克雷伯菌（KP）是医院和社区获得性感染的重要因素，被世界卫生组织（WHO）列为急需研发新抗生素的耐药致病菌。有研究表明，碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌(CRKP)是全球增长最快的抗生素耐药性威胁之一。碳青霉烯酶类耐药基因的存在可以使细菌在不同程度水解碳青霉烯类及其他β内酰胺类抗生素，在可移动遗传元件的帮助可以在细菌中传播。CRKP在已在临床、农业及环境中出现和传播，严重威胁了公共卫生安全。

参考文献：①Wang,Y.,etal.Detectionofmobilecolistinresistancegenemcr-9incarbapenem-resistantKlebsiellapneumoniaestrainsofhumanorigininEurope.JournalofInfection,(),doi:10.6/j.jinf..12..

②David,S.,etal.Epidemicofcarbapenem-resistantKlebsiellapneumoniaeinEuropeisdrivenbynoso

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